MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Repeats of Synechocystis sp. PCC 6803 chromosome

Total Repeats: 66870

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_000911	GC	3	6	2	7	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
2	NC_000911	GTG	2	6	68	73	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
3	NC_000911	GCG	2	6	88	93	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
4	NC_000911	TCT	2	6	167	172	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
5	NC_000911	GGT	2	6	202	207	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
6	NC_000911	ATT	2	6	211	216	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_000911	A	6	6	306	311	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_000911	CT	3	6	328	333	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
9	NC_000911	TG	4	8	385	392	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
10	NC_000911	ATC	2	6	393	398	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
11	NC_000911	CCGG	2	8	488	495	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
12	NC_000911	AATT	2	8	567	574	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_000911	GA	3	6	721	726	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
14	NC_000911	GTC	2	6	759	764	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
15	NC_000911	T	6	6	786	791	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_000911	T	6	6	836	841	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_000911	TGC	2	6	971	976	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329172
18	NC_000911	CCA	2	6	1026	1031	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329172
19	NC_000911	GCG	2	6	1089	1094	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329172
20	NC_000911	C	6	6	1162	1167	0 %	0 %	0 %	100 %	16329172
21	NC_000911	TCC	2	6	1173	1178	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329172
22	NC_000911	CCA	2	6	1202	1207	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329172
23	NC_000911	CCCTA	2	10	1278	1287	20 %	20 %	0 %	60 %	16329172
24	NC_000911	CAG	2	6	1349	1354	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	16329172
25	NC_000911	GAA	2	6	1417	1422	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329172
26	NC_000911	A	6	6	1471	1476	100 %	0 %	0 %	0 %	16329172
27	NC_000911	CTCC	2	8	1501	1508	0 %	25 %	0 %	75 %	Non-Coding
28	NC_000911	C	6	6	1507	1512	0 %	0 %	0 %	100 %	Non-Coding
29	NC_000911	ATC	2	6	1565	1570	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
30	NC_000911	GCC	2	6	1613	1618	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329173
31	NC_000911	GAA	2	6	1619	1624	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329173
32	NC_000911	CAGG	2	8	1643	1650	25 %	0 %	50 %	25 %	16329173
33	NC_000911	TGG	2	6	1713	1718	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
34	NC_000911	A	6	6	1724	1729	100 %	0 %	0 %	0 %	16329173
35	NC_000911	TCA	2	6	1806	1811	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329173
36	NC_000911	CCT	2	6	1867	1872	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329173
37	NC_000911	GTG	2	6	1991	1996	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
38	NC_000911	GGT	2	6	2000	2005	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329173
39	NC_000911	AAC	2	6	2016	2021	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329173
40	NC_000911	TTTG	2	8	2090	2097	0 %	75 %	25 %	0 %	16329173
41	NC_000911	GAA	2	6	2128	2133	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
42	NC_000911	C	6	6	2228	2233	0 %	0 %	0 %	100 %	16329174
43	NC_000911	GTC	2	6	2378	2383	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329174
44	NC_000911	TGGAG	2	10	2411	2420	20 %	20 %	60 %	0 %	16329174
45	NC_000911	CCA	2	6	2421	2426	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329174
46	NC_000911	AAT	2	6	2750	2755	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329174
47	NC_000911	GCG	2	6	2797	2802	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329174
48	NC_000911	T	8	8	2817	2824	0 %	100 %	0 %	0 %	16329174
49	NC_000911	CAT	2	6	2831	2836	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329174
50	NC_000911	GTT	2	6	2840	2845	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329174
51	NC_000911	TAT	2	6	2906	2911	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_000911	GCG	2	6	2923	2928	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	Non-Coding
53	NC_000911	AC	3	6	2930	2935	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
54	NC_000911	A	6	6	2940	2945	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_000911	TTCA	2	8	3013	3020	25 %	50 %	0 %	25 %	Non-Coding
56	NC_000911	AGC	2	6	3048	3053	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
57	NC_000911	TCA	2	6	3233	3238	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329175
58	NC_000911	ATCG	2	8	3324	3331	25 %	25 %	25 %	25 %	16329175
59	NC_000911	GTT	2	6	3338	3343	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329175
60	NC_000911	ATT	2	6	3387	3392	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329175
61	NC_000911	AAT	2	6	3402	3407	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329175
62	NC_000911	TGG	2	6	3524	3529	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329175
63	NC_000911	GAA	2	6	3546	3551	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329175
64	NC_000911	AGGT	2	8	3751	3758	25 %	25 %	50 %	0 %	16329175
65	NC_000911	AAG	2	6	3784	3789	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329175
66	NC_000911	TTG	2	6	3853	3858	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329175
67	NC_000911	CAA	2	6	3912	3917	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329175
68	NC_000911	GGT	2	6	4170	4175	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329175
69	NC_000911	TCA	2	6	4234	4239	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329175
70	NC_000911	GTT	2	6	4272	4277	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
71	NC_000911	CAAT	2	8	4303	4310	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
72	NC_000911	G	7	7	4391	4397	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
73	NC_000911	TTG	2	6	4423	4428	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
74	NC_000911	AGT	2	6	4446	4451	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329176
75	NC_000911	GTT	2	6	4459	4464	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329176
76	NC_000911	TGG	2	6	4543	4548	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
77	NC_000911	AAT	2	6	4595	4600	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329176
78	NC_000911	TGG	2	6	4756	4761	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
79	NC_000911	TCT	2	6	4869	4874	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
80	NC_000911	CAA	2	6	4949	4954	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329176
81	NC_000911	TTC	2	6	4988	4993	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
82	NC_000911	TCT	2	6	5013	5018	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329176
83	NC_000911	CA	3	6	5066	5071	50 %	0 %	0 %	50 %	16329176
84	NC_000911	T	6	6	5078	5083	0 %	100 %	0 %	0 %	16329176
85	NC_000911	TGG	2	6	5094	5099	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329176
86	NC_000911	CAT	2	6	5123	5128	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329176
87	NC_000911	C	6	6	5178	5183	0 %	0 %	0 %	100 %	16329176
88	NC_000911	AATT	2	8	5309	5316	50 %	50 %	0 %	0 %	16329176
89	NC_000911	CAA	2	6	5320	5325	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329176
90	NC_000911	TGGT	2	8	5389	5396	0 %	50 %	50 %	0 %	16329176
91	NC_000911	AGGG	2	8	5415	5422	25 %	0 %	75 %	0 %	Non-Coding
92	NC_000911	CCA	2	6	5456	5461	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
93	NC_000911	GTT	2	6	5486	5491	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
94	NC_000911	CCA	2	6	5650	5655	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329177
95	NC_000911	TAA	2	6	5732	5737	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329177
96	NC_000911	TCA	2	6	5766	5771	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329177
97	NC_000911	CCA	2	6	5857	5862	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329177
98	NC_000911	CGG	2	6	6036	6041	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329177
99	NC_000911	G	6	6	6040	6045	0 %	0 %	100 %	0 %	16329177
100	NC_000911	GGT	2	6	6164	6169	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329177
101	NC_000911	GAA	2	6	6210	6215	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329177
102	NC_000911	TCT	2	6	6387	6392	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329177
103	NC_000911	GCG	2	6	6398	6403	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329177
104	NC_000911	GTG	2	6	6408	6413	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329177
105	NC_000911	GAT	2	6	6478	6483	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329177
106	NC_000911	ATG	2	6	6519	6524	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329177
107	NC_000911	CAA	3	9	6548	6556	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329177
108	NC_000911	AAC	2	6	6602	6607	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329177
109	NC_000911	A	6	6	6800	6805	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_000911	ACTG	2	8	6868	6875	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
111	NC_000911	ATT	2	6	6924	6929	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
112	NC_000911	ATT	2	6	6934	6939	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
113	NC_000911	A	6	6	7068	7073	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
114	NC_000911	CAA	2	6	7300	7305	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
115	NC_000911	GGTT	2	8	7319	7326	0 %	50 %	50 %	0 %	16329178
116	NC_000911	TGA	2	6	7335	7340	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329178
117	NC_000911	CCA	2	6	7359	7364	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329178
118	NC_000911	TCA	2	6	7371	7376	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
119	NC_000911	CGC	2	6	7387	7392	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
120	NC_000911	C	6	6	7394	7399	0 %	0 %	0 %	100 %	16329178
121	NC_000911	AAC	2	6	7451	7456	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
122	NC_000911	ATC	2	6	7457	7462	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
123	NC_000911	TGT	2	6	7471	7476	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329178
124	NC_000911	CTT	2	6	7479	7484	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
125	NC_000911	GGT	2	6	7553	7558	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329178
126	NC_000911	GTA	2	6	7571	7576	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329178
127	NC_000911	GTC	2	6	7611	7616	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329178
128	NC_000911	TG	3	6	7658	7663	0 %	50 %	50 %	0 %	16329178
129	NC_000911	CCG	2	6	7692	7697	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
130	NC_000911	GGT	2	6	7847	7852	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329178
131	NC_000911	CCT	3	9	7887	7895	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329178
132	NC_000911	ACC	2	6	7907	7912	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	16329178
133	NC_000911	AAG	3	9	7950	7958	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329178
134	NC_000911	ACA	2	6	7965	7970	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
135	NC_000911	GCC	2	6	7976	7981	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329178
136	NC_000911	CTT	2	6	8016	8021	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
137	NC_000911	CAA	2	6	8023	8028	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329178
138	NC_000911	CTT	3	9	8044	8052	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329178
139	NC_000911	TTCAAC	2	12	8126	8137	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329178
140	NC_000911	CTG	2	6	8295	8300	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329178
141	NC_000911	AAT	2	6	8334	8339	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
142	NC_000911	G	6	6	8364	8369	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
143	NC_000911	TCT	2	6	8392	8397	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
144	NC_000911	ATCG	2	8	8418	8425	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
145	NC_000911	AG	3	6	8452	8457	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
146	NC_000911	GAA	2	6	8498	8503	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329179
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151	NC_000911	G	6	6	8601	8606	0 %	0 %	100 %	0 %	16329179
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186	NC_000911	CAA	2	6	10631	10636	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329180
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267	NC_000911	TGTT	2	8	14607	14614	0 %	75 %	25 %	0 %	Non-Coding
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276	NC_000911	TGG	2	6	14984	14989	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329183
277	NC_000911	TCCT	2	8	15024	15031	0 %	50 %	0 %	50 %	16329183
278	NC_000911	TGC	2	6	15032	15037	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	16329183
279	NC_000911	GGT	2	6	15055	15060	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329183
280	NC_000911	GCG	2	6	15067	15072	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	16329183
281	NC_000911	TGG	2	6	15128	15133	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	16329183
282	NC_000911	TG	3	6	15427	15432	0 %	50 %	50 %	0 %	16329183
283	NC_000911	CCG	2	6	15437	15442	0 %	0 %	33.33 %	66.67 %	16329183
284	NC_000911	ATT	2	6	15768	15773	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
285	NC_000911	GAA	2	6	15817	15822	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
286	NC_000911	AAT	2	6	15898	15903	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
287	NC_000911	TTA	2	6	15912	15917	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_000911	TAA	2	6	15929	15934	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
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302	NC_000911	TGGCCC	2	12	16409	16420	0 %	16.67 %	33.33 %	50 %	16329184
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373	NC_000911	GA	3	6	20606	20611	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
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402	NC_000911	GTT	2	6	22259	22264	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329188
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408	NC_000911	AAT	2	6	22336	22341	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329188
409	NC_000911	TCC	2	6	22360	22365	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	16329188
410	NC_000911	A	6	6	22431	22436	100 %	0 %	0 %	0 %	16329188
411	NC_000911	AT	3	6	22472	22477	50 %	50 %	0 %	0 %	16329188
412	NC_000911	A	6	6	22486	22491	100 %	0 %	0 %	0 %	16329188
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414	NC_000911	TTTC	2	8	22509	22516	0 %	75 %	0 %	25 %	16329188
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425	NC_000911	TACA	2	8	22881	22888	50 %	25 %	0 %	25 %	16329188
426	NC_000911	T	6	6	22918	22923	0 %	100 %	0 %	0 %	16329188
427	NC_000911	AAT	2	6	22932	22937	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329188
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431	NC_000911	ATTT	2	8	23120	23127	25 %	75 %	0 %	0 %	16329188
432	NC_000911	ATTA	2	8	23134	23141	50 %	50 %	0 %	0 %	16329189
433	NC_000911	TCA	2	6	23216	23221	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329189
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435	NC_000911	CAA	2	6	23399	23404	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329189
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441	NC_000911	CAA	2	6	23699	23704	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	16329189
442	NC_000911	ATC	2	6	23784	23789	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	16329189
443	NC_000911	TTC	2	6	23802	23807	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329189
444	NC_000911	AAT	2	6	23850	23855	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329189
445	NC_000911	TGA	2	6	23935	23940	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329189
446	NC_000911	ATG	2	6	23973	23978	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	16329189
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449	NC_000911	A	6	6	24162	24167	100 %	0 %	0 %	0 %	16329190
450	NC_000911	ATA	2	6	24200	24205	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329190
451	NC_000911	ATTG	2	8	24231	24238	25 %	50 %	25 %	0 %	16329190
452	NC_000911	TGT	3	9	24261	24269	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	16329190
453	NC_000911	ATA	2	6	24345	24350	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329190
454	NC_000911	ATT	2	6	24362	24367	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	16329190
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462	NC_000911	TCT	2	6	24624	24629	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329190
463	NC_000911	TCT	2	6	24649	24654	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	16329190
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474	NC_000911	AAG	2	6	25078	25083	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	16329190
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480	NC_000911	A	7	7	25238	25244	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
481	NC_000911	AAT	3	9	25290	25298	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	16329191
482	NC_000911	ACTG	2	8	25335	25342	25 %	25 %	25 %	25 %	16329191
483	NC_000911	A	6	6	25409	25414	100 %	0 %	0 %	0 %	16329191
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497	NC_000911	AGAA	2	8	26336	26343	75 %	0 %	25 %	0 %	16329191
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